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【Cell】10x Genomics单细胞多组学二阶发育中的人类大脑皮层的染色质

时间:2025-02-13 12:29:00

者错综繁杂关联开放性的含糊DNA基本功能,主要取自PCW24一个组织,解读AQP4、TNC、ALDH2和APOE,以及五角形囊状肝细胞中都特异开放性解读的其他DNA(m2, m13, m14)。为了筛选这些转录系统开放性但相异的亚群究竟与相异的DNA解读核苷酸系统开放性,我们量化了m13和m14中都与DNA系统开放性的增强子错综繁杂的相异motif丰度。我们找到 (bHLH)核苷酸motif ASCL1和NHLH1在器件m13中都富含,而SOX21在器件m14中都富含。在我们的囊状肝细胞中都,ASCL1和NHLH1 motif的意味著避免与bHLH核苷酸OLIG1的DNA解读最系统开放性(Spearman rho计有0.34和0.36),我们之前所已经高票SOX21作为神经元类器官中都五角形肝细胞成熟的潜在抑制剂。因此,两种相异的五角形肝细胞样解读方式上可以通过肝细胞的可达开放性分辨OLIG1和SOX21均匀分布。

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深度学习仿真对ASD中都的

毁坏开放性非序列DNA突变的科学知识研究

使用我们的研究成果来解释ASD中都的非序列最初生DNA突变,使用Simons Simplex Collection附录,该附录扩展到了1,902个代人中都的有约20万个此类DNA突变。在我们的仿真中都,一个水平毁坏开放性的DNA突变位于NFIA的真核脊椎动物中都。当年该DNA功能缺失DNA突变与ASD有关。该DNA突变起因在NFIA靶DNA的一个连锁真核脊椎动物增强子中都。我们掩蔽到,这种增强子在相异类别的GluN亚群中都是特别可出访的。GluN6的BPNet仿真假设DNA突变毁坏了一个NFIA motif,指出该DNA突变意味著通过基本功能抑制反馈失调NFIADNA的解读。在nIPC亚群中都,BPNet仿真假设了一个与脑肽YDNA(NPY)相互连接起来的DNA间增强子起因了毁坏开放性由头DNA突变,其TSS靠近DNA突变90kb。NPY在子板中都解读,在孕期中都期本能神经元的早期RG中都解读, NPY介导DNA组缺失与ASD有关。该仿真进一步假设了这一由头DNA突变都会毁坏肝细胞环锚点上的CTCF建构核苷酸,指出这意味著对该核苷酸的肝细胞结构诱发潜在的机制影响。

科学知识研究亮点

单肝细胞RNA和肝细胞研究成果建立联系量化描绘了本能大脑神经元成年期每一次中都的DNA解读机制 相异的TFs是脑起因和囊状起因抑制流程的典范 代人不得不的转录核苷酸在分化成早期的肝细胞状态比较活跃 利用脑网络对自闭症代人身心中都的非序列最初生DNA突变进行时了科学知识研究 2021年

单肝细胞ATAC+DNA解读部分书评集锦

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